- Centro de Biotecnología Genómica (CBG)
- Centro de Desarrollo Aeroespacial (CDA)
- Centro de Desarrollo de Productos Bióticos (CEPROBI)
- Centro de Educación Continua (CEC), Ingeniero Eugenio Méndez Docurro
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 10) “Carlos Vallejo Márquez”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 11) “Wilfrido Massieu”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 13) “Ricardo Flores Magón”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 16) “Hidalgo”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 17) “León, Guanajuato”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 18) “Zacatecas”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 19) "Leona Vicario"
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 2) “Miguel Bernard”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 3) “Estanislao Ramírez Ruiz”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 7) “Cuauhtémoc”
- Centro de Estudios Científicos y Tecnológicos (CECyT 8) “Narciso Bassols”
- Centro de Innovación y Desarrollo Tecnológico en Cómputo (CIDETEC)
- Centro de Investigación e Innovación Tecnológica (CIITEC)
- Centro de Investigación en Biotecnología Aplicada (CIBA), Unidad Tlaxcala
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA), Unidad Altamira
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA), Unidad Legaria
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA), Unidad Morelos
- Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada (CICATA), Unidad Querétaro
- Centro de Investigación en Computación (CIC)
- Centro de Investigaciones Económicas, Administrativas y Sociales (CIECAS)
- Centro de Investigación y Desarrollo de Tecnología Digital (CITEDI)
- Centro de Nanociencias y Micro y Nanotecnologías (CNMN)
- Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud, Unidad Milpa Alta (CICS-Milpa Alta)
- Centro Interdisciplinario de Ciencias de La Salud, Unidad Santo Tomás (CICS-Santo Tomás)
- Centro Interdisciplinario de Ciencias Marinas (CICIMAR)
- Centro Interdisciplinario de Investigaciones y Estudios sobre Medio Ambiente y Desarrollo (CIIEMAD)
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR), Unidad Durango
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR), Unidad Michoacán
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR),Unidad Oaxaca
- Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR), Unidad Sinaloa
- Centro Mexicano para la Producción más Limpia (CMP+L)
- Centro Nacional de Cálculo (CENAC)
- Comisión de Operación y Fomento de Actividades Académicas (COFAA)
- Coordinación General de Formación e Innovación Educativa (CGFIE)
- Coordinación Politécnica para la Sustentabilidad (CPS)
- Dirección de Formación e Innovación Educativa (DFIE)
- Escuela Nacional de Ciencias Biológicas (ENCB)
- Escuela Nacional de Medicina y Homeopatía (ENMH)
- Escuela Superior de Comercio y Administración, Unidad Santo Tomás (ESCA- Santo Tomás)
- Escuela Superior de Comercio y Administración, Unidad Tepepan (ESCA- Tepepan)
- Escuela Superior de Cómputo (ESCOM)
- Escuela Superior de Economía (ESE)
- Escuela Superior de Enfermería y Obstetricia (ESEO)
- Escuela Superior de Física y Matemáticas (ESFM)
- Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME), Unidad Azcapotzalco
- Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME), Unidad Culhuacán
- Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME), Unidad Ticomán
- Escuela Superior de Ingeniería Mecánica y Eléctrica (ESIME), Unidad Zacatenco
- Escuela Superior de Ingeniería Química e Industrias Extractivas (ESIQIE)
- Escuela Superior de Ingeniería y Arquitectura (ESIA), Unidad Tecamachalco
- Escuela Superior de Ingeniería y Arquitectura (ESIA), Unidad Ticomán
- Escuela Superior de Ingeniería y Arquitectura (ESIA), Unidad Zacatenco
- Escuela Superior de Medicina (ESM)
- Escuela Superior de Turismo (EST)
- https://www.upiem.ipn.mx/
- Secretaría de Innovación e Integración Social (SIIS)
- Secretaría de Investigación y Posgrado
- Unidad de Desarrollo Tecnológico (TECHNOPOLI)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnología (UPIBI)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Coahuila (UPIIC)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Guanajuato (UPIIG)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Hidalgo (UPIIH)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Palenque (UPIIP)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Tlaxcala (UPIIT)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería, Campus Zacatecas (UPIIZ)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería y Ciencias Sociales y Administrativas (UPIICSA)
- Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingeniería y Tecnologías Avanzadas (UPIITA)